Don Cartagena – третий студийный альбом, официальный релиз которого состоялся в 1998 году. Его отметили на 7-й позиции в Billboard 200 и на второй – в Top R & B / Hip Hop. Лонгплей сертифицирован RIAA как золотой . Популярные хиты - "Don Cartagena" и "Bet Ya Man Can't Triz". К работе над сборником артист привлек Jadakiss, Big Pun, Bone Thugs-N-Harmony, Diddy, Nas, Raekwon.
В 2001 году Fat Joe записал свой четвертый альбом - Jealous Ones Still Envy (сокращенное название J.O.S.E.). В работе над сборником приняли участие Busta Rhymes, Ashanti, N.O.R.E., Ludacris, Petey Pablo, R. Kelly, Ja Rule, M.O.P., Buju Banton и прочие. Хитом стала композиция "What's Luv", занявшая второе место в хит-параде Billboard Hot 100.
В 2003 году Джозеф записал совместную работу "I Want You" с мексиканской певицей Thalía. Известный трек "Crush Tonight” появился благодаря сотрудничеству с Тони Саншайн.
Шестой альбом появился в 2005 году. Fat Joe назвал его All or Nothing. Композиции "So Much More", "Get It Poppin" и "My Fofo" были записаны как призывы против набирающего тогда популярности рэпера 50 Cent. Музыканты не поделили шанс на сотрудничество с Ja Rule. В ответ 50 Cent записал "Piggy Bank". В альбоме также есть и обычные треки, записанные с Nelly, Mase, Eminem, Madonna и R. Kelly.
Me, Myself & I – седьмой альбом исполнителя появился в 2007 году. Это была его первая работа с Virgin Records. Хитами стали "Make It Rain" и "No Drama". Лонгплей занял второе место в чарте Top Rap Albums.
Восьмой сольный альбом The Elephant in the Room музыкант записал в 2008 году с лейблом Imperial Records. Треки из лонгплея заняли престижные места в чарте Billboard Hot 100.
J.O.S.E. 2 стал девятым сольным альбомом рэпера. Дебютировал лонгплей в 2009 году на 73-й позиции авторитетного чарта Billboard 200. За первую неделю продаж разошлось около 11 тысяч копий.
Очередной десятый лонгплей артист выпустил в 2010 году. The Darkside Vol. 1 за первую неделю после попадания в ротацию, разошелся 12 тысячами копий и занял 27-е место в Billboard 200.
В интервью MTV RapFix Live by Sway Fat Joe заявил, что в его планах записать еще 2 части The Darkside, а после закончить сольную карьеру.
В 2011 году Джо выпустил синглы, которые должны стать частью The Darkside Vol. 2. Это композиции "Yellow Tape" и "Another Round". В 2013 вышел очередной трек для нового альбома - "Ballin".
В 2016 музыкант снова участвовал в проекте D.I.T.C. при записи их студийного альбома Sessions. Совместно с Реми Ма в 2017 году Fat Boy записал лонгплей Plata O Plomo.
Музыкант продолжает активную творческую деятельность. Он записывает новый альбом под названием Family Ties. Дата выхода альбома пока неизвестна.