Когда троица только начинала играть, они были студентами в Университета Майами. Вилламизар и Лопес изучали управление бизнесом, а Фрейре – кинопроизводство.
Студенты сошлись на почве общей страсти – музыки и вскоре поняли, что она станет главным делом их жизни. Изначально пределом мечтаний группы был сбор толп в барах Майами. Для этого они стали играть панк-рок. Второй причиной выбора этого направления были юношеские предпочтения участников, которые любили Прница, Guns N' Roses и Rolling Stones. Интересно отметить, что Лопес, который родился в Бразилии, начал познавать мир латиноамериканской музыки только когда переехал в США.
Как и Лопес, Вилламизар тоже хотел играть поп-музыку на английском языке. Особенно ему нравились Битлз. Однако его мать, учительница музыки, научила его играть несколько латиноамериканских песен на гитаре. Именно она привлекла сына к изучению колумбийской, перуанской и бразильской музыки.
Фрейре вырос в Пуэрто-Рико, где он слушал оперную музыку, так как именно она интересовала его отца. Однако мальчик, как и другие участники группы, увлекался англоязычными песнями. Ему нравились Kiss и Питер Фрэмптон. Когда все его друзья крутили сальсу, Фрейре выделялся своей любовью к Led Zepplin.
К 2000 году, Бактерия определилась со звучанием. Их музыка превратилась в смесь рока, ска, регги, босса нова, и других жанров. Участник добавили звучание скрипки, виолончели и духовых инструментов. В начале 2000-го Bacilos подписали контракт с WEA. Вместе они выпустили первый альбом Bacilos. Лонглпей оказался очень успешным и был номинирован на премию Latin Grammy. Однако ни одна из песен из альбома не стала международном хитом. Группа поспешила исправить недочет в следующем альбоме.
В 2002 году, коллектив записал свой самый успешный альбом Caraluna. Он был номинирован на три премии Latin Grammy. На этот раз одна премия все же досталась ребятам в номинации Best Pop Album by a Duo or Group with Vocals. Песня из этого альбома “Mi Primer Million” стала настоящим хитом и песней года 2002. Сингл занял 18 место в хит-парадах Billboard Hot Latin Songs и Latin Pop Songs. В 2003 году, за нее группа получила премию Latin Грэмми в номинации Best Tropical Song. Артисты сумели сделать так, что заказать Bacilos для выступления в клубах Майами, куда они так стремились попасть, стало практически невозможно. Они вышли на новый уровень.
В 2004 году группа выпустила следующий альбом под названием Sin Verguenza. Первый сингл из альбома “Pasos de Gigante” занял первую строчку в хит-параде Аргентины, вторую в Чили и попал в первую десятку синглов на Billboard Latin. В 2005 году альбом получил премию Latin Grammy в номинации Best Pop Album by a Duo or Group with Vocals.
В 2006 году артисты во время тура по США, участники сообщили о распаде группы. В 2007 году они один раз выступили в Чили и пропали со сцены на 10 лет. В 2017 году группа воссоединилась и выпустила новый хит "Por Hacerme el Bueno".
