Роджер Уотерс родился в 1943 году в Грейт-Букхеме, в Англии, в семье учителей, Эрика и Мэри Уотерс. Отец погиб в боях за Италию во время Второй Мировой Войны, когда малышу исполнилось всего пять месяцев. Мать переехала в Кембридж, где одна растила Роджера и его старшего брата.
Вначале мальчик учился в Morley Memorial Junior School, затем в Cambridgeshire High School for Boys, где познакомился с Сидом Барретом и Дэвидом Гилмором, будущими членами команды Пинк Флойд. В школе юноша увлекался регби и крикетом, активно участвовал в пацифистском движении за разоружение. В 1962 году Роджер поступил в Политехнический институт центрального Лондона с целью продолжить карьеру в области машиностроения, но позже решил изучать архитектуру. Здесь он встретил Ника Мэйсона и Ричарда Райта.
В 1963 году Уотерс, Мейсон и Райт вместе с Ноблом и Меткалфом организовали группу Sigma 6, которая играла на небольших мероприятиях и репетировала в подвале института. К концу года вместо ушедших Нобла и Меткалфа к группе присоединился Баррет. После множества переименований она приобрела окончательное название, Пинк Флойд.
В августе 1967 года вышел первый альбом группы The Piper at the Gates of Dawn, для которого Уотерс написал только одну песню, “Take Up Thy Stethoscope and Walk”. В начале 1968 года Баррету, из-за ухудшения психического здоровья, пришлось покинуть команду. В группу вошел Дэвид Гилмор, а Роджер Уотерс стал играть ведущую роль в Пинк Флойде. Большинство текстов для альбомов The Dark Side of the Moon, Wish You Were Here, Animals, The Wall и Final Cut было написано им.
