C 1989 года Филипп путешествует с Аллой Борисовской в Австралии Германии, в качестве партнера. И выезжает на первые сольные гастроли в г. Пермь. В этом же году выходит в финал фестиваля «Песня года». В конце 1989 Киркоров покидает «Театр Аллы Пугачёвой» и начинает сольную концертную деятельность.
С 1990 года начинает невероятный взлёт популярности артиста. C песней «Небо и земля» он получает Гран-при на конкурсе «Шлягер-90» в Ленинграде. В 1992 его видео на песню композитора А. Лукьянова «Атлантида» признано лучшим клипом года. Параллельно Филипп записывает две сольные программы «Небо и земля» и «Атлантида»; и гастролирует по США, Канаде, Германии и Израиле. В 1993 год Филипп успешно гастролирует по Австралии и получает премию «Овация» в номинации «Лучший певец года» а так же премию международного конкурса «Золотой Орфей».
13 января 1994 года Филипп и Алла объявили о помолвке в Москве. 15 марта их брак был зарегистрирован в Санкт-Петербурге, мэром города А. Собчаком. Венчание прошло 15 мая в Иерусалиме. В этом году певец выпускает сольную программу «Я не Рафаэль», и записывает песню «Я поднимаю свой бокал». В ноября проходит совместный грандиозный концерт пары в самом большом казино Америки «Тадж-Махал», Атлантик-Сити. Следующий год пара посвятила совместному концертному туру по Израилю, а так же съемкам видео клипов. Филипп получает ещё 2 премии «Овация» — «За лучшую программу» и «Лучший певец», и занимает 17 место в международном конкурсе «Евровидение». В конце года певец презентует новую концертную программу «Лучшее, любимое и только для Вас» в Государственном Театре эстрады, и выпускает двойной компакт-диск «Скажи солнцу: „Да!“».
За рекордный тираж среди российских исполнителей (2 миллиона звуконосителей) в 1996 году Филипп получает награду World Music Awards в категории «Самый продаваемый артист в России». Следующий год посвящён мировому туру по 100 городам России, СНГ и дальнего зарубежья с программой «Лучшее, любимое и только для Вас!». Завершает тур серия ежедневных концертов в «БКЗ Октябрьский» (Санкт-Петербург) «Только один месяц и только для Вас!».
1999 год посвящен большому гастрольному туру Киркорова по Германии. А так же записи новой концертной программы «Ой, мама, шика дам!». В июне он плучает приглашение от короля поп музыки Майкла Джексона представлять Россию в благотворительной программе «Michael Jackson and Friends. What more can I give».
В 2002 году Киркоров продюсирует постановку русской версии мюзикла «Чикаго», где по совместительству исполняет главную мужскую роль. Проект был признан «Премьерой года». С 2003 года Филипп дебютирует в качестве телеведущего, ведет на телеканале СТС программу «Утро с Киркоровым» К сожалению проект просуществовал недолго, до 2005 года. В этом же году Филипп Киркоров и Алла Пугачева официально объявили о разводе. После расставания с Аллой Филипп начал сниматься в картинах и появляться на широких экранах. Главные роли он сыграл в фильмах «Салон красоты», «Любовь в большом городе» (3 части), а так же участвовал в мюзиклах «Вечера на хуторе близ Диканьки», «Безумный день», «Приключения Верки-Сердючки» и в мексиканской теленовелле «Как в кино».
В 2011 году певец выпустил альбом «ДруGOY» и выступал с одноимённой концертной программой. Этот год был для него особенным, потому что в ноябре у певца родилась дочь Алла-Виктория, названая в честь Аллы Пугачевой и матери Филиппа — Виктории. Крестным малышки стал известный телеведущий Андрей Малахов.
В 2012 Филипп снова становится отцом. 29 июня 2012 года он объявляет о рождении мальчика, сына называет Мартин-Кристо, в честь своего кумира и певца Рики Мартина.
Сейчас певец занимается продюссированием и выступает с концертными программами.